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生物系统定性模型的抽象理论

计算工程、金融与科学 2010-11-03 v1 离散数学

摘要

多值网络模型是生物学界广泛使用的一种重要的定性建模方法。在本文中,我们考虑为多值网络模型开发一种抽象理论,允许在保留模型关键性质的同时缩减模型的状态空间。这非常重要,因为它有助于多值网络的分析与比较,特别是有助于解决与此类分析相关的著名的状态空间爆炸问题。我们还考虑开发高效识别抽象的技术,从而为该任务的自动化提供基础。我们通过研究已发表的 λ 噬菌体裂解-溶原开关的两个 MVN 模型的抽象识别,来说明所开发的理论与技术。

关键词

引用

@article{arxiv.1011.0489,
  title  = {An Abstraction Theory for Qualitative Models of Biological Systems},
  author = {Richard Banks and L. Jason Steggles},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1011.0489},
  year   = {2010}
}

备注

In Proceedings MeCBIC 2010, arXiv:1011.0051