调控网络多值逻辑模型中的最小化与等价性
动力系统
2016-01-28 v2
摘要
多值逻辑模型可用于基于网络结构和捕获调控效应的逻辑参数,在高度抽象层次上描述生物网络。有趣的是,两个不同模型的动力学不一定不同,这可能暗示要么只有非功能特征区分模型,要么相同行为有不同的可能实现。此处,我们通过分析动态等价模型类以及此类类的结构最大和最小表示,研究允许这种效应的条件。最后,我们提出一个高效算法,用于构造给定多值模型的相应类的最小表示。
引用
@article{arxiv.1509.06962,
title = {Minimization and Equivalence in Multi-valued Logical Models of Regulatory Networks},
author = {Adam Streck and Therese Lorenz and Heike Siebert},
journal= {arXiv preprint arXiv:1509.06962},
year = {2016}
}
备注
a preprint of a journal version, contains a correction to Algorithm 1, lines 6 and 7