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调控网络多值逻辑模型中的最小化与等价性

动力系统 2016-01-28 v2

摘要

多值逻辑模型可用于基于网络结构和捕获调控效应的逻辑参数,在高度抽象层次上描述生物网络。有趣的是,两个不同模型的动力学不一定不同,这可能暗示要么只有非功能特征区分模型,要么相同行为有不同的可能实现。此处,我们通过分析动态等价模型类以及此类类的结构最大和最小表示,研究允许这种效应的条件。最后,我们提出一个高效算法,用于构造给定多值模型的相应类的最小表示。

关键词

引用

@article{arxiv.1509.06962,
  title  = {Minimization and Equivalence in Multi-valued Logical Models of Regulatory Networks},
  author = {Adam Streck and Therese Lorenz and Heike Siebert},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1509.06962},
  year   = {2016}
}

备注

a preprint of a journal version, contains a correction to Algorithm 1, lines 6 and 7