RWTH-GE在ISBI 2019细胞分割基准竞赛中使用的算法
计算机视觉与模式识别
2019-04-16 v1 细胞行为
摘要
所提出的分割与跟踪算法遵循检测、跟踪并最终分割细胞核的三步法。在预处理阶段，我们使用卷积神经网络（CNN）处理2D图像，使用高斯拉普拉斯尺度空间最大投影方法处理3D数据集，以检测细胞核质心。跟踪在预测种子点上以逆向方式进行，即从最后一帧开始顺序连接对应对象直至第一帧。对应关系通过将第t帧的检测传播至其前一帧t-1，并使用层次聚类方法合并冗余检测来识别。随后将跟踪得到的质心作为种子分水岭算法变体的输入，以获得最终分割。
引用
@article{arxiv.1904.06890,
title = {Algorithms used for the Cell Segmentation Benchmark Competition at ISBI 2019 by RWTH-GE},
author = {Dennis Eschweiler and Johannes Stegmaier},
journal= {arXiv preprint arXiv:1904.06890},
year = {2019}
}
备注
4 pages, algorithms used for the Cell Segmentation Benchmark competition at IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2019 in Venice, Italy