由溶剂可及性和反应动力学结合蛋白质质谱揭示等离子体驱动的生物催化中的苯丙氨酸修饰
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2025-06-26 v1 人工智能
摘要
生物催化是一种提供环保替代方案的新兴领域，但仍面临一些挑战。对于需要如H2O2等反应性物种作为共反应物的生物催化剂，最大难题之一在于控制这些反应性物种的浓度。一方面它们用作反应物，另一方面它们在高浓度下会失活酶原。当利用非热等离子体为生物催化提供H2O2时，必须理解等离子体生成的物种(PGS)与酶之间的潜在相互作用。这尤其重要，因为除了\ch{H2O2}之外，其他如羟基自由基、原子氧、过氧化氢和硝氧也会被产生。对酶溶剂可及表面积(SASA)的局部反应性进行调查，是预测这些相互作用的重要工具。结合反应性分子动力学(MD)模拟，这使我们能够识别可能被PGS修饰的氨基酸残基。本研究的理论预测中一部分结果已通过质谱实验得到确认，凸显了基于SASA和MD的筛选方法在指导耗时的实验以及辅助其解释方面的实用性。
引用
@article{arxiv.2506.20204,
title = {Affective Priming Score: A Data-Driven Method to Detect Priming in Sequential Datasets},
author = {Eduardo Gutierrez Maestro and Hadi Banaee and Amy Loutfi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2506.20204},
year = {2025}
}