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用于三维线粒体实例分割的先进深度网络

计算机视觉与模式识别 2022-05-10 v4

摘要

自深度学习方法引入以来,基于电子显微镜(EM)图像的线粒体实例分割取得了显著进展。本文提出两种先进深度网络,名为 Res-UNet-R 和 Res-UNet-H,用于从大鼠(Rat)和人类(Human)样本中进行三维线粒体实例分割。具体而言,我们设计了一个简单而有效的各向异性卷积块,并采用多尺度训练策略,二者共同提升了分割性能。此外,我们通过添加去噪操作作为预处理,增强了训练模型在测试集上的泛化能力。在 ISBI 2021 大规模三维线粒体实例分割挑战赛(Large-scale 3D Mitochondria Instance Segmentation Challenge)中,我们的方法获得第一名。代码见 https://github.com/Limingxing00/MitoEM2021-Challenge。

关键词

引用

@article{arxiv.2104.07961,
  title  = {Advanced Deep Networks for 3D Mitochondria Instance Segmentation},
  author = {Mingxing Li and Chang Chen and Xiaoyu Liu and Wei Huang and Yueyi Zhang and Zhiwei Xiong},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2104.07961},
  year   = {2022}
}