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通过相空间维度的连续变化实现自适应分子分辨率

统计力学 2007-05-23 v1

摘要

为了通过计算机模拟研究复杂的合成和生物分子系统,人们仍然局限于简单的模型系统或远远过小的时间尺度。为了克服这个问题,多尺度技术正在被开发用于许多应用。然而,在几乎所有情况下,不同分辨率的区域是固定的,并且彼此之间并非真正的平衡。我们在这里给出了一个高效且灵活耦合不同区域的理论框架。该方法导致了类似几何诱导相变的现象,以及分数自由度均分定理的对应物。这为应用不同分辨率水平的先进计算机模拟方法提供了一个相当通用的形式基础。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0609019,
  title  = {Adaptive molecular resolution via a continuous change of the phase space dimensionality},
  author = {Matej Praprotnik and Kurt Kremer and Luigi Delle Site},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0609019},
  year   = {2007}
}