用于细胞分辨率上皮组织力学描述的活性顶点模型
生物物理
2016-12-20 v1 软凝聚态物质
摘要
我们引入一种活性顶点模型（AVM），用于对由数万个细胞组成的融合上皮组织进行细胞分辨率的力学研究，其细节层次是同类方法无法达到的。AVM 将用于融合上皮组织的顶点模型与活性物质动力学相结合。这引入了对细胞运动的自然描述，并解释了在多个尺度上观察到的运动模式。此外，细胞接触是根据细胞中心的位置动态生成的。这不仅实现了高效的数值计算，还为导致局部组织重排的 T1 转变事件提供了自然描述。AVM 还包含了细胞排列、细胞特异性力学性质、细胞生长、分裂和凋亡。此外，AVM 引入了一个灵活的、动态变化的上皮片边界，允许研究诸如指进不稳定性或伤口愈合等现象。我们通过若干案例研究展示了这些能力。
引用
@article{arxiv.1612.05960,
title = {Active Vertex Model for Cell-Resolution Description of Epithelial Tissue Mechanics},
author = {Daniel L. Barton and Silke Henkes and Cornelis J. Weijer and Rastko Sknepnek},
journal= {arXiv preprint arXiv:1612.05960},
year = {2016}
}
备注
33 pages, 14 figure