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机械力解折叠单分子的二态动力学模型

生物物理 2012-08-27 v1 软凝聚态物质

摘要

我们利用表示实验数据所需的最简单模型,研究了机械力不可逆解折叠单分子过程中耗散的功。该模型由两个能级(折叠态与解折叠态)构成,其间由一中间势垒隔开。我们计算了耗散功的概率分布,并给出了该分布平均值与方差的解析表达式。在一阶近似下,耗散功的量与施力速率(加载速率)以及分子的弛豫时间成正比。该模型给出的受力解折叠动力学特征参数估计值与近期实验结果一致(Liphardt, J., et al. (2002) {\em Science}, {\bf 296} 1832-1835)。我们利用 Jarzynski 公式,得到了从非平衡实验中获得平衡自由能(在 kBTk_BT 范围内)所需重复实验最少次数的一般方程。不可逆实验的次数随平均耗散功 \Wdisˉ\bar{\Wdis}kBTk_BT 之比呈指数增长。

关键词

引用

@article{arxiv.physics/0210063,
  title  = {A two-state kinetic model for the unfolding of single molecules by mechanical force},
  author = {F. Ritort and C. Bustamante and I. Tinoco,},
  journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0210063},
  year   = {2012}
}

备注

PDF file, 5 pages