蛋白质组学中用于错误发现率控制的目标-诱饵搜索策略的理论基础
应用统计
2015-01-06 v1 统计理论
统计理论
摘要
动机：目标-诱饵搜索（TDS）目前是基于质谱的鸟枪法蛋白质组学中估计和控制肽鉴定的错误发现率（FDR）的最流行策略。尽管该策略在实践中非常有用并且已被广泛实证研究，但其理论基础尚未很好建立。结果：在这项工作中，我们以严格的统计意义系统分析TDS策略。我们证明常用的串联TDS对于任何给定得分阈值提供FDR的保守估计，但它不能严格控制FDR。我们证明通过对常用的FDR估计公式稍作修改，基于串联TDS可以严格控制肽水平的FDR。我们表明谱水平的FDR控制是困难的。我们用真实质谱数据验证理论结论。
引用
@article{arxiv.1501.00537,
title = {A theoretical foundation of the target-decoy search strategy for false discovery rate control in proteomics},
author = {Kun He and Yan Fu and Wen-Feng Zeng and Lan Luo and Hao Chi and Chao Liu and Lai-Yun Qing and Rui-Xiang Sun and Si-Min He},
journal= {arXiv preprint arXiv:1501.00537},
year = {2015}
}
备注
7 pages, 2 figures