基于主副浸�集的 RNA 聚类与多尺度校正方法
生物大分子
2026-03-04 v2 定量方法
应用统计
摘要
RNA 结构确定是理解其生物功能的关键步骤,但重构过程常面临原子碰撞等挑战,可能导致模型不准确。为此,我们提出一种基于主副浸�集(PSM)的方法用于 torus 上的 RNA 数据分析。该方法提供了准确的低维特征表示,克服了先前基于 torus 方法的局限。将 PSM 与 DBSCAN 结合,我们提出一种新型聚类技术,即基于主副浸�集的 DBSCAN(PSM-DBSCAN)。我们的方法在聚类准确率方面取得优异成绩,并对噪声具有更强鲁棒性。此外,我们将该方法用于多尺度校正,有效解决了 RNA 主链在微观和中尺度尺度上的原子碰撞问题。广泛的仿真和比较研究表明,我们的方法在精度和可扩展性方面显著优于现有方法,为纠正复杂 RNA 结构及其在结构生物学和生物信息学中的应用提供了稳健的基础。
引用
@article{arxiv.2503.20513,
title = {A Principal Submanifold-based Approach for Clustering and Multiscale RNA Correction},
author = {Menghao Wu and Zhigang Yao},
journal= {arXiv preprint arXiv:2503.20513},
year = {2026}
}
备注
30 pages, 15 figures