一种用于GeneRank问题的新预条件子
数值分析
2014-03-18 v1
摘要
识别与特定疾病相关的关键基因是生物医学研究中一个非常重要的问题。GeneRank模型基于PageRank算法,保留了其许多数学性质。该模型将基因表达信息与网络结构相结合,并根据微阵列实验的结果结合基因表达信息(例如来自基因注释GO)对基因进行排序。在本研究中,我们提出了一种新的预条件共轭梯度算法来解决GeneRank问题,并研究了其性质。给出了一些数值实验以表明所建议预条件子的有效性。
引用
@article{arxiv.1403.3925,
title = {A New Preconditioner for the GeneRank Problem},
author = {Davod Khojasteh Salkuyeh and Vahid Edalatpour and Davod Hezari},
journal= {arXiv preprint arXiv:1403.3925},
year = {2014}
}
备注
10 pages, 3 figures