列表表示框架：通过引入基因可交换性实现列表稳定化
应用统计
2015-03-19 v1 统计理论
统计计算
统计理论
摘要
对来自例如微阵列研究的多变量数据集的分析，通常会产生与某些感兴趣响应相关联的基因列表。由于抽样变异导致的所得基因列表的统计不稳定性，生物学解释往往变得复杂，这部分可能是由于基因间的功能冗余性，意味着多个基因可以在细胞中扮演可交换的角色。在本文中，我们使用随机变量的可交换性概念来建模这种功能冗余，从而解释归因于抽样变异的不稳定性。我们提出了一个灵活的框架，将可交换性纳入列表的表示中。所提出的框架支持任意两个列表之间直接的稳健比较。它还可用于生成新的、更稳定的基因排名，这些排名结合了来自实验数据的更多信息。使用来自肺癌患者的微阵列数据集，我们表明所提出的方法在抽样变异方面提供了比现有方法更稳健的基因排名，同时不损害生物学意义。
引用
@article{arxiv.1103.2876,
title = {A framework for list representation, enabling list stabilization through incorporation of gene exchangeabilities},
author = {Charlotte Soneson and Magnus Fontes},
journal= {arXiv preprint arXiv:1103.2876},
year = {2015}
}