一种基于指纹的晶体结构相似性度量
计算物理
2016-02-17 v2 材料科学
摘要
测量原子结构之间的相似性/差异性对于探索势能面至关重要。然而，通常用于描述周期性系统的晶胞矢量与原子坐标，并非适合作为区分结构的指纹。基于对晶胞中所有原子局域环境的表征，我们引入了易于计算的晶体指纹，并允许定义满足度量数学性质的晶体结构间的构型距离。两个构型之间的这一距离是其相似性/差异性的度量，尤其能够区分结构。该新方法在多种势能面探索方案中是一个有用的工具，例如极小值跳跃、随机搜索、群体智能算法和高通量筛选。
引用
@article{arxiv.1507.06730,
title = {A fingerprint based metric for measuring similarities of crystalline structures},
author = {Li Zhu and Maximilian Amsler and Tobias Fuhrer and Bastian Schaefer and Somayeh Faraji and Samare Rostami and S. Alireza Ghasemi and Ali Sadeghi and Migle Grauzinyte and Christopher Wolverton and Stefan Goedecker},
journal= {arXiv preprint arXiv:1507.06730},
year = {2016}
}