EuroForMix 与 STRmix 主要差异的成因诊断
应用统计
2023-07-04 v1
摘要
人们对比较两种概率基因型分析软件 EuroForMix (EFM) 和 STRmix 的输出（主要是似然比）感兴趣。许多此类比较研究是描述性的，很少或根本没有努力诊断差异的成因。EFM 和 STRmix 之间存在根本性差异，这些差异导致了最大一组似然比差异。这组差异出现在虚假供体（false donors）情形中：对于 EFM 存在大量似然比刚好高于或低于 1 的实例，而在 STRmix 中给出低得多的似然比。这是由 EFM 在 Hp 和 Ha 下分别估计诸如等位基因峰高方差和混合比例等参数所导致的。这造成了 EFM 在似然比刚好高于和低于 1 区域偏离校准。
引用
@article{arxiv.2307.00015,
title = {A diagnosis of the primary difference between EuroForMix and STRmix},
author = {John Buckleton and Mateusz Susik and James M. Curran and Kevin Cheng and Duncan Taylor and Jo-Anne Bright and Hannah Kelly and Richard Wivell},
journal= {arXiv preprint arXiv:2307.00015},
year = {2023}
}
备注
21 pages, 9 figures, 5 tables