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YAP/TAZ机械感知的计算模型

生物物理 2016-06-28 v1 亚细胞过程

摘要

在细胞增殖、干细胞分化、化疗抗性和组织构建中,YAP/TAZ的普遍作用持续影响我们在众多生理和疾病系统中的基本理解。YAP/TAZ是整合多种机械和生化信号(如ECM刚度、粘附配体密度或细胞-细胞接触)的重要信号枢纽,从而强烈影响细胞命运。最近研究表明YAP/TAZ机械感知依赖于RhoA调节的应力纤维。然而,由于经典Hippo通路与细胞张力间未知的相互作用,目前对YAP/TAZ的理解仍有限。为确定关键信号分子在机械信号感知和转导中的作用,我们提出YAP/TAZ信号通路的新计算模型。该模型通过粘附将ECM机械特性转换为生化信号,并整合与细胞骨架动力学相关的细胞内信号级联。预测粘附分子如FAK通过RhoA通路在软环境中挽救YAP/TAZ活性。我们发现分子浓度变化导致YAP/TAZ刚度响应不同模式。我们还研究YAP/TAZ活性对ECM刚度的敏感性。此外,模型显示机械感知与Hippo通路间YAP/TAZ活性的未解决的协同效应可由LIMK和LATS的相互作用解释。总之,我们的模型提供研究整合不同信号通路背景下YAP/TAZ活性的新平台。该平台可用于获得关于关键分子和机械调节子在发育、组织工程或肿瘤进展中作用的新基本见解。

关键词

引用

@article{arxiv.1604.03532,
  title  = {A Computational Model of YAP/TAZ Mechanosensing},
  author = {Meng Sun and Fabian Spill and Muhammad H. Zaman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1604.03532},
  year   = {2016}
}

备注

19 pages, 7 pages supporting material, 4 figures, 4 supporting figures