一种解释大脑中基因共表达模式的基于细胞类型的模型
定量方法
2012-01-06 v2 神经元与认知
摘要
脊椎动物大脑中的大部分基因组都会表达，单个基因表现出不同的空间变化表达模式。这些变化并非独立的，成对的基因表现出复杂的共表达模式，使得两个基因可能在一个区域相似表达，但在其他区域差异表达。这些相关性此前已被定量研究，特别是针对小鼠大脑的基因表达图谱，但共表达模式的生物学意义仍不清楚。我们提出了一个用潜在细胞类型空间分布来解释共表达模式的简单模型。我们基于一组测试细胞类型确立了该模型的合理性，这些细胞类型的基因表达谱和空间分布均是已知的。
引用
@article{arxiv.1111.6217,
title = {A cell-type based model explaining co-expression patterns of genes in the brain},
author = {Pascal Grange and Jason Bohland and Hemant Bokil and Sacha Nelson and Benjamin Okaty and Ken Sugino and Lydia Ng and Michael Hawrylycz and Partha P. Mitra},
journal= {arXiv preprint arXiv:1111.6217},
year = {2012}
}
备注
41 pages; v2: typos corrected