基于基因表达的生物标志物指示受控与自然环境下植物的水分状况
定量方法
2013-10-10 v1
摘要
在许多科学领域中，植物或土壤的水分状况对于理解植物对干旱的响应至关重要。由于对非生物胁迫（如水分亏缺）的转录组响应反映了植物的水分状况，因此基因组工具可用于开发新型分子生物标志物。本研究以向日葵（Helianthus annuus L.）为模式物种，研究了其在温室和田间条件下对水分亏缺的转录组响应，特异性地鉴定出三个基因，其表达模式与受控条件下估算的植物水分状况指标（包括黎明前叶片水势、可蒸腾土壤水分分数、土壤含水量或总土壤水分分数）高度相关。我们建立了一个广义线性模型，利用这三个选定基因的表达水平来估算这些经典的水分状况指标。该估算独立于所测试的四种基因型及植物发育阶段（开花前或开花后）。此外，我们在田间条件下对四种基因型在三次不同试验中、跨越大范围水分状况对该基因表达生物标志物进行了验证，并能够对其在较大昼夜采样时段内的表达值进行校正。
引用
@article{arxiv.1310.2542,
title = {A biomarker based on gene expression indicates plant water status in controlled and natural environments},
author = {Gwenaëlle Marchand and Baptiste Mayjonade and Didier Varès and Nicolas Blanchet and Marie-Claude Boniface and Pierre Maury and Fety Andrianasolo Nambinina and Philippe Burger and Philippe Debaeke and Pierre Casadebaig and Patrick Vincourt and Nicolas B. Langlade},
journal= {arXiv preprint arXiv:1310.2542},
year = {2013}
}
备注
Plant, Cell & Environment, 2013