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AutoImplant的基线方法:MICCAI 2020颅植入物设计挑战赛

计算机视觉与模式识别 2020-06-25 v2 图形学 机器学习 图像与视频处理

摘要

在本研究中,我们提出AutoImplant(https://autoimplant.grand-challenge.org/)——颅植入物设计挑战赛的基线方法,按组织者的建议,该任务可表述为体形状学习任务。在此任务中,缺损颅骨、完整颅骨与颅植入物均以二值体素网格表示。为完成该任务,植入物既可直接由缺损颅骨重建,也可通过缺损颅骨与完整颅骨之差获得。在后一种情况下,须由缺损颅骨重建完整颅骨,这定义了一个体形状补全问题。我们针对该任务的基线方法基于前一种表述,即训练深度神经网络由缺损颅骨直接预测植入物。该方法分两步生成高质量植入物:首先,编码-解码网络由下采样的缺损颅骨学习植入物的粗表示;粗植入物仅用于在原始高分辨率颅骨中生成缺损区域的包围盒。其次,训练另一编码-解码网络由包围区域生成精细植入物。在测试集上,所提方法取得平均Dice相似系数(DSC)0.8555与Hausdorff距离(HD)5.1825 mm。代码公开于https://github.com/Jianningli/autoimplant。

关键词

引用

@article{arxiv.2006.12449,
  title  = {A Baseline Approach for AutoImplant: the MICCAI 2020 Cranial Implant Design Challenge},
  author = {Jianning Li and Antonio Pepe and Christina Gsaxner and Gord von Campe and Jan Egger},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2006.12449},
  year   = {2020}
}

备注

12 pages