人与小鼠基因组中替换速率的涨落
基因组学
2009-11-10 v1 种群与进化
摘要
我们提出了一种量化真核生物基因组中不同长度尺度上替换速率空间涨落的方法。发现大长度尺度上的涨落主要是较短长度尺度上涨落的粗粒化效应的结果。这一点在小鼠和人类基因组中均得到验证。我们还发现尽管两物种平均替换速率相差两倍,但其涨落的标准差相似。我们的方法进一步允许确定时间分辨的替换速率图,由此可计算自相关函数以量化替换速率的空间涨落随时间变化的速度。
引用
@article{arxiv.q-bio/0403044,
title = {Variations in Substitution Rate in Human and Mouse Genomes},
author = {H. H. von Grünberg and M. Kollmann},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0403044},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 3 Figs