解析生态相互作用测度的时序依赖性

物种间相互作用（范围从直接的捕食者-猎物关系到由环境中介的间接效应）是生态系统平衡和生物多样性的核心。虽然存在用于测量这些相互作用的实证方法，但其可解释性和局限性尚不明确。本文检讨了广泛使用的成对相互作用矩阵，并分析其时序可变性。我们指出，相互作用强度的看似波动（甚至相互作用符号的变化，常被解释为从竞争到共生的转换）可以从具有固定生态角色的种群动力学中本质性地产生。实验程序进一步塑造了这些估计：观察持续时间和微生物生长研究中的实验设置类型（例如培养基、批次培养或资源条件）会系统性地影响测量到的相互作用。考虑跨尺度的相互作用可增强可解释性：短期测量主要捕捉直接的种群耦合，而长期观察越来越反映间接的社区反馈。综合这些结果，本文确立了以短期推断（无论是直接还是外推）来消除直接相互作用与间接相互作用的原则方法。基于这一洞见，我们提出一种模型推断方法，利用多个短时间序列而非扩展的纵向数据集。