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无标签数据引导的半监督组织病理学图像分割

计算机视觉与模式识别 2020-12-18 v1

摘要

自动组织病理学图像分割对疾病分析至关重要。在完全监督设定下,有限的可用标签数据阻碍了训练模型的泛化能力。基于生成方法的半监督学习(SSL)已被证明在利用多样化图像特征方面是有效的。然而,尚未充分探索何种生成图像对模型训练更有用,以及如何使用这些图像。本文中,我们提出一种新的数据引导生成方法,通过利用无标签数据分布来进行组织病理学图像分割。首先,我们设计了一个图像生成模块。图像内容与风格被解耦并嵌入到利于聚类的空间中以利用其分布。通过采样并交叉组合内容与风格来合成新图像。其次,我们设计了一种有效的数据选择策略以审慎地采样生成图像:(1)为使生成的训练集更好地覆盖数据集,对原始训练集中代表性不足的簇给予更多覆盖;(2)为使训练过程更有效,我们识别并过采样数据中“困难样本”的图像,这些图像的标注训练数据可能稀缺。我们的方法在腺体与细胞核数据集上进行了评估。我们表明,在归纳与直推两种设定下,我们的SSL方法持续提升了常见分割模型的性能并达到了最先进(SOTA)结果。

关键词

引用

@article{arxiv.2012.09373,
  title  = {Unlabeled Data Guided Semi-supervised Histopathology Image Segmentation},
  author = {Hongxiao Wang and Hao Zheng and Jianxu Chen and Lin Yang and Yizhe Zhang and Danny Z. Chen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2012.09373},
  year   = {2020}
}

备注

Accepted paper for the 2020 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)