系统与合成生物学中的数值延拓与分岔理论教程
定量方法
2020-08-13 v1
摘要
数学建模使我们能够简洁地描述生物学中的基本原理。模型分析既有助于解释已知现象，也有助于预测新的、未见行为。模型分析通常是一项复杂任务，以至于我们别无选择，只能以计算方法逼近该问题。数值延拓是一种通过计算算法检测分岔来分析非线性模型动力学的计算方法。在此我们旨在通过提供非线性动力学与数值分岔分析的导论来促进数值延拓工具的使用。许多数值延拓软件包可供使用，涵盖广泛的系统类别；我们对这些软件包进行了综述，以帮助新手和有经验的实践者根据其需求选择合适的软件工具。
引用
@article{arxiv.2008.05226,
title = {Tutorial of numerical continuation and bifurcation theory for systems and synthetic biology},
author = {Mark Blyth and Ludovic Renson and Lucia Marucci},
journal= {arXiv preprint arXiv:2008.05226},
year = {2020}
}
备注
14 pages, 2 figures, 2 tables