具有磷酸化的随机化学反应网络的热力学极限
概率论
2026-06-29 v1 分子网络
摘要
在本文中,我们研究了生物细胞的基本机制之一——磷酸化的稳定性性质。该系统是一个化学反应网络(CRN),其中一种化学物质,即底物,可以通过两种类型的酶的活性依次转化为两种磷酸化形式,一种类型用于磷酸化,另一种用于去磷酸化。我们在质量作用动力学下研究了该模型的随机表示。底物的总质量固定为,而酶的总质量与成比例缩放。研究了当很大时,所有化学物质浓度的渐近行为。我们研究了质量作用定律动力学下化学物质可能的稳定子集。稳定子集是这样的:在方便的初始状态下,当变大时,该子集物种的拷贝数在任何有限时间间隔内保持。从这个角度研究了十二个反应速率常数,即CRN的催化常数的作用。为CRN的几种状态建立了相应马尔可夫过程的平均原理。特别表明,存在一个具有三个平衡点的状态,其中两个是稳定的。结果的证明依赖于带泊松过程的随机微积分、马尔可夫过程坐标子集的方便耦合、队列的技术结果以及中动力系统的稳定性分析。
引用
@article{arxiv.2606.30325,
title = {Thermodynamic Limits of Stochastic Chemical Reaction Networks with Phosphorylation},
author = {Lucie Laurence and Philippe Robert},
journal= {arXiv preprint arXiv:2606.30325},
year = {2026}
}