偶氮苯衍生物的的热半衰期：基于机器学习势与系间窜越的虚拟筛选
化学物理
2023-01-13 v5 机器学习
摘要
分子光开关是光激活药物的基础。一种关键的光开关是偶氮苯，其在光照下呈现反式–顺式异构现象。顺式异构体的热半衰期至关重要，因为它控制着光诱导生物效应的持续时间。在此我们引入一种预测偶氮苯衍生物热半衰期的计算工具。我们的自动化方法使用在量子化学数据上训练的快速且准确的机器学习势。基于已确立的早期证据，我们认为热异构化通过由系间窜越介导的旋转进行，并将该机制纳入我们的自动化工作流。我们利用该方法预测了 19,000 种偶氮苯衍生物的热半衰期。我们探究了势垒与吸收波长之间的趋势与权衡，并开源了我们的数据与软件以加速光药理学研究。
引用
@article{arxiv.2207.11592,
title = {Thermal half-lives of azobenzene derivatives: virtual screening based on intersystem crossing using a machine learning potential},
author = {Simon Axelrod and Eugene Shakhnovich and Rafael Gomez-Bombarelli},
journal= {arXiv preprint arXiv:2207.11592},
year = {2023}
}