理论分析预测A20调控NF-κB振荡周期
生物物理
2009-11-04 v1 计算物理
细胞行为
分子网络
摘要
NF-κB的核质穿梭表现为核浓度阻尼振荡，时间周期约为1-2小时。NF-κB网络包含多个反馈环路，调节NF-κB活性的整体响应。虽然已知IκBα驱动振荡而IκBε抑制振荡，但A20负反馈的确切作用仍有待阐明。在此，我们提出了一个聚焦于三个负反馈环路（IκBα、IκBε和A20）的NF-κB系统模型，该模型能够捕捉野生型和敲除细胞中实验观察到的响应。我们发现，A20与IκBε类似，尽管通过不同的机制，也能有效抑制振荡。然而，此外我们还发现了A20的一个新功能作用，即它控制核NF-κB的振荡周期。基于三个嵌套反馈环路的设计，允许独立控制振荡响应中的周期和振幅衰减。基于这些结果，我们预测通过调整A20的表达水平（例如通过siRNA），周期可以改变多达2倍。
引用
@article{arxiv.0911.0529,
title = {Theoretical analyses predict A20 regulates period of NF-kB oscillation},
author = {Benedicte Mengel and Sandeep Krishna and Mogens H. Jensen and Ala Trusina},
journal= {arXiv preprint arXiv:0911.0529},
year = {2009}
}