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包裹 cargo 在微区室组装中的作用

生物物理 2019-05-07 v2 软凝聚态物质

摘要

细菌微区室是大型的、大致二十面体状的壳层,其围绕细菌中某些代谢途径相关的酶与反应物组装。受微区室组装的启发,我们使用粗粒化计算与理论建模来研究控制围绕数百至数千个分子组装的蛋白质壳层尺寸与形态的因素。我们在有和无cargo的情况下,于一系列相互作用强度、亚基与cargo化学计量比以及壳层自发曲率条件下进行壳层组装的动力学模拟。依据这些参数,我们发现如近期实验所见,cargo的存在相对于其本征自发曲率既可增大也可减小壳层尺寸。这些特征由动力学与热力学效应的平衡所控制,且壳层尺寸依赖于组装路径。我们讨论了这些结果对于将新酶靶向微区室内部的合成生物学工作的启示。

关键词

引用

@article{arxiv.1807.07137,
  title  = {The role of the encapsulated cargo in microcompartment assembly},
  author = {Farzaneh Mohajerani and Michael F. Hagan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1807.07137},
  year   = {2019}
}

备注

11 pages, Supporting Information(10 pages)