过渡金属离子在生物分子中角力的功能形式

本文概述了一种用于生成关于$\sigma$键过渡金属离子周围角力的方法，并推广以处理$\pi$键构型。该理论方法基于对配体场哈密顿量基于电子态分布矩的分析。获得的函数形式涉及对通常的结合能表达式的修改，即作为配体-配体相互作用之和，但这只需极少的CPU时间增加。角力具有简单形式，涉及sin和cos函数，其相对权重取决于配体是$\sigma$键还是$\pi$键。它们以约10%的准确度描述配体场稳定能。所得力场用于模型化小型簇的结构，包括铜蓝蛋白结构片段。当$\pi$键配体存在时，发现与典型正四面体铜配位结构相隔离较大。