外显子连接复合体经历组成转换,改变mRNP结构和无义介导的mRNA衰变活性
基因组学
2018-07-03 v1
摘要
沉积在mRNA外显子连接上游的外显子连接复合体(EJC)塑造了剪接后mRNA核糖核蛋白颗粒(mRNP)的结构、组成和命运。为此,EJC核心核化了外围蛋白的动态外壳,这些蛋白在多种转录后过程中发挥作用。为了阐明EJC组成变化的后果,我们通过外围蛋白RNPS1和CASC3从人类细胞中纯化了EJC。我们表明,EJC最初是一个富含SR的兆道尔顿大小的RNP,包含RNPS1但缺乏CASC3。在mRNP输出到细胞质后、翻译之前,EJC经历了一次显著的组成和结构重塑,变成一个不含SR的单体复合体,包含CASC3。令人惊讶的是,RNPS1对一般的无义介导的mRNA衰变(NMD)很重要,而CASC3仅对特定mRNA的NMD是必需的。向CASC3-EJC的转换促进会减慢NMD。总体而言,EJC组成转换显著改变了mRNP结构,并指定了EJC依赖性NMD的两个不同阶段。
引用
@article{arxiv.1807.00789,
title = {The exon junction complex undergoes a compositional switch that alters mRNP structure and nonsense-mediated mRNA decay activity},
author = {Justin W. Mabin and Lauren A. Woodward and Robert Patton and Zhongxia Yi and Mengxuan Jia and Vicki Wysocki and Ralf Bundschuh and Guramrit Singh},
journal= {arXiv preprint arXiv:1807.00789},
year = {2018}
}