DNA碱基排列顺序对表面增强拉曼散射谱的影响
化学物理
2021-02-23 v1 光学
摘要
表面增强拉曼散射(SERS)过程使得吸附在等离激元金属上的分子的拉曼散射截面大幅增强,并受到诸多物理化学因素的影响,如金属表面的几何与光学性质、化学吸附分子的取向以及化学环境。尽管SERS在单分子灵敏度和DNA序列光学传感方面具有前景,但要提升现有及未来基于SERS的DNA传感平台的预测能力,仍需更深入理解各因素之间丰富的物理化学相互作用。本工作中,我们报道了实验结果表明,由于DNA碱基间的分子内相互作用,吸附的单链DNA(ssDNA)异构体的SERS谱依赖于3个碱基长的ssDNA中各个碱基出现的顺序。此外,我们通过实验证明,当分子不因共振电荷转移效应而经历化学增强,以及在无电磁或化学增强的标准拉曼散射下,该效应在更一般的条件下依然成立。我们的数值模拟在定性上支持实验发现,并表明碱基排列顺序会导致拉曼谱和化学增强拉曼谱均发生改变。
引用
@article{arxiv.2102.10512,
title = {The effect of DNA bases permutation on surface enhanced Raman scattering spectrum},
author = {Shimon Rubin and Phuong H. L. Nguyen and Yeshaiahu Fainman},
journal= {arXiv preprint arXiv:2102.10512},
year = {2021}
}
备注
31 pages, 9 figures