SWEEPFINDER2:增强的灵敏度、鲁棒性与灵活性
种群与进化
2015-05-28 v1
摘要
SweepFinder 是一个广受欢迎的程序,实现了一种基于似然的强大方法,用于检测近期正选择或选择性清除。在此,我们提出 SweepFinder2,它是 SweepFinder 的扩展,增强了对突变率变异和背景选择的混杂效应的灵敏度与鲁棒性,同时提升了灵活性,使用户能够更详细地检查基因组区域并指定测试位点间的固定距离。此外,SweepFinder2 支持利用不变位点进行清除检测,相较于 SweepFinder 同时提升了效力与精度。
引用
@article{arxiv.1505.07142,
title = {SWEEPFINDER2: Increased sensitivity, robustness, and flexibility},
author = {Michael DeGiorgio and Christian D. Huber and Melissa J. Hubisz and Ines Hellmann and Rasmus Nielsen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1505.07142},
year = {2015}
}