Superheat:用于可视化复杂数据的精美可扩展热力图的 R 包
应用统计
2017-01-30 v2 统计方法学
摘要
现代时代的技术进步使得在科学等领域能够收集海量数据。从这些大规模数据集中提取有用信息是一项持续面临的挑战,因为传统数据可视化工具在高维场景下通常难以扩展。热图是一种特别适合可视化大规模数据集的现有技术。尽管热图在生物信息学等领域用于可视化大规模基因表达数据集时极为流行,但它们在现代数据分析中仍然严重被低估。本文介绍 superheat,一个新的 R 包,提供了一个极其灵活且可定制的平台,利用可扩展热图来可视化大规模数据集。Superheat 通过在热图上叠加响应变量的散点图、模型结果的箱线图、相关性信息的条形图、文本信息等,增强了传统热图的功能。Superheat 允许用户更深入地探索数据,并利用数据中存在的异质性来指导分析决策。本文的目标 twofold:(1)通过可复现的示例展示热图作为广泛数据类型默认可视化方法的潜力;(2)强调 superheat 包在 R 中的可定制性和易实现性。superheat 包的功能和基本适用性将通过三个案例研究进行探索,每个案例研究均基于公开可用的数据源,并附有概述逐步分析流程(含代码)的文件。
引用
@article{arxiv.1512.01524,
title = {Superheat: An R package for creating beautiful and extendable heatmaps for visualizing complex data},
author = {Rebecca L Barter and Bin Yu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1512.01524},
year = {2017}
}
备注
26 pages, 10 figures