体相和膜上网格蛋白自组装的结构与路径
软凝聚态物质
2014-11-18 v1 生物物理
生物大分子
摘要
我们提出了一个网格蛋白的粗粒化模型,该模型在计算上易于处理,同时包含了关键的观测定性特征:具有腿间排除体积的三脚结构;体相中多态笼子的组装;膜上芽的形成。我们使用蒙特卡洛模拟和包含流体动力学相互作用的分子动力学(后者采用新的膜边界条件)研究了该模型的组装。在体相中,组装了一系列已知的网格蛋白结构。识别出一条涉及多个小簇合并的膜出芽路径。
引用
@article{arxiv.1411.4239,
title = {Structures and pathways for clathrin self-assembly in the bulk and on membranes},
author = {Richard Matthews and Christos N. Likos},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.4239},
year = {2014}
}
备注
15 pages, 14 figures