物理上合理的多色团系统中的结构-动力学关系
化学物理
2017-05-23 v2 生物物理
量子物理
摘要
我们研究了大量物理上合理的色团排列，这些排列通过对天然存在的“参考”结构进行随机实空间变换的计算方法生成，并以研究充分的 Fenna-Matthews-Olson 复合体（FMO）为例说明我们的方法。为了探索天然结构已被优化以实现高效能量传输的观点，我们使用原子跃迁电荷方法计算了每个生成结构的激子耦合，并使用 Lindblad 主方程研究了激子从“源”色团到“漏”色团的量子传输。我们发现结构与传输效率之间存在显著的相关性：高性能结构往往更紧凑，且其中最佳结构表现出色团的特定取向，特别是最接近源至漏矢量的色团。我们得出结论，在合理的、物理驱动的约束条件下，FMO 复合体高度适应能量传输的目的，部分原因在于它利用了这些结构基序。
引用
@article{arxiv.1704.01795,
title = {Structure-Dynamics Relation in Physically-Plausible Multi-Chromophore Systems},
author = {George C. Knee and Patrick Rowe and Luke D. Smith and Alessandro Troisi and Animesh Datta},
journal= {arXiv preprint arXiv:1704.01795},
year = {2017}
}
备注
7+6pp, 3+10 figures. Accepted version. Data available at http://doi.org/10.6084/m9.figshare.c.3784874.v1