基于 QSAR 和分子对接预测与验证 LmGt 抑制剂
计算机视觉与模式识别
2025-05-13 v1
摘要
致病疮疮由致病原子丝虫 mexicana 引起，依赖于致病原子丝虫 mexicana 葡萄糖转运蛋白（LmGT）受体，后者在寄生虫生命周期的不同阶段发挥重要作用。以往的 LmGT 抑制剂识别工作主要基于体外筛选。然而，这种传统方法受限于效率低、成本高和特异性差，导致在开发针对 LmGT 的靶向治疗候选药物时存在显著缺口。本研究采用计算技术来弥补这一缺口，通过开发定量结构-活性关系模型（QSAR），利用支持向量机分类器识别新型 LmGt 抑制剂。QSAR 模型在区分活性化合物方面达到了 0.81 的准确率。分子对接进一步验证了所识别的抑制剂，显示其与靶点的结合亲和力强，最高得分为 -9.46。对接分析显示，抑制剂通过形成多个氢键并占据与 Phase 3 药物候选物相同的结合口袋。所测试的抑制剂来源于天然来源，表明其副作用较小、生物相容性更好。这一结合方法展示了计算模型在加速药物发现方面的潜力，为针对致病原子丝虫 mexicana 提供更高效、更具生物相容性的治疗方案。
引用
@article{arxiv.2505.07747,
title = {Step1X-3D: Towards High-Fidelity and Controllable Generation of Textured 3D Assets},
author = {Weiyu Li and Xuanyang Zhang and Zheng Sun and Di Qi and Hao Li and Wei Cheng and Weiwei Cai and Shihao Wu and Jiarui Liu and Zihao Wang and Xiao Chen and Feipeng Tian and Jianxiong Pan and Zeming Li and Gang Yu and Xiangyu Zhang and Daxin Jiang and Ping Tan},
journal= {arXiv preprint arXiv:2505.07747},
year = {2025}
}
备注
Technical report