SPIM-Flow：用于水螅水动力学研究的集成光片与微流控平台
生物物理
2023-09-18 v1 定量方法
摘要
选择性平面照明显微镜（SPIM），或称光片，是一种强大的三维成像方法。然而，显微镜与微流控的接入与接口一直具有挑战性。与微流控的复杂接口限制了 SPIM 在研究自由运动多细胞生物的水动力学方面的效用。我们开发了 SPIM-Flow，一种廉价的光片平台，可轻松与微流控集成。我们使用 SPIM-Flow 在毫米级腔室（宽 4 mm、高 1.5 mm）中研究自由运动的水螅水螅体的水动力学。我们在多个动物身上进行的初始实验、在芯片上喂食（以 Artemia franciscana 桡足幼体为食）以及基线行为（例如触手摆动、伸长和弯曲）表明动物在系统内健康。SPIM 使得在较大腔室内轻松成像自由运动的动物和示踪微珠（用于流体可视化）。接下来，利用腔室，我们考察了水螅对流动的响应。结果表明，动物通过沿流动方向弯曲和摆动触手来响应已建立的流动。最后，我们使用先前描述的视频分析软件（FlowTrace）来可视化由水螅产生（例如生成的涡旋）和围绕水螅（例如由于流动）的路径线。这些结果证明了 SPIM-Flow 在研究自由运动动物水动力学方面的效用。
关键词
引用
@article{arxiv.2208.14430,
title = {SPIM-Flow, an integrated light-sheet and microfluidics platform for hydrodynamic studies of Hydra},
author = {Per Niklas Hedde and Erika L. Gomez and Leora Duong and Robert E. Steele and Siavash Ahrar},
journal= {arXiv preprint arXiv:2208.14430},
year = {2023}
}
备注
16 pages, 5 figures, 5 supplementary figures, 5 supplementary videos