sPEGG:基于商用图形处理器的高通量生态-进化模拟
定量方法
2016-03-31 v1 种群与进化
摘要
将群体遗传学整合进群落生态理论是生态与进化的主要目标,但分析所得模型在计算上令人畏惧。在此我们描述 sPEGG( on (GPGPUs)),一个开源多物种前向时间群体遗传学模拟器。使用单个商用 GPGPU 代替单个中央处理器,我们发现 sPEGG 可将生态-进化模拟加速超过 200 倍,相当于中小规模计算机集群的性能。
引用
@article{arxiv.1603.09255,
title = {sPEGG: high throughput eco-evolutionary simulations on commodity graphics processors},
author = {Kenichi W. Okamoto and Priyanga Amarasekare},
journal= {arXiv preprint arXiv:1603.09255},
year = {2016}
}