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基于再生核Hilbert空间结构保持低秩去噪的SNR增强扩散MRI

医学物理 2020-09-15 v1 图像与视频处理

摘要

目的:介绍、开发并评估一种用于扩散 MRI 的新型去噪技术,该技术利用数据中的非线性冗余以提升 SNR 同时保持信号信息。方法:我们通过核主成分分析(KPCA)——PCA 到再生核 Hilbert 空间的非线性推广——来利用 dMRI 数据的非线性冗余。通过将信号映射到高维空间,尽管数据中存在非线性,仍可实现更好的冗余,从而比线性 PCA 实现更好的去噪。我们使用高斯核实现 KPCA,其参数根据噪声统计知识自动选取,并在逼真的蒙特卡洛模拟以及体内人脑亚毫米分辨率 dMRI 数据上验证。我们也使用多通道 dMRI 数据演示 KPCA 去噪。结果:在使用 KPCA 去噪的真实体内数据集中获得了高达 2.7 倍的 SNR 提升,而使用最先进 PCA 去噪(如 Marchenko-Pastur PCA(MPPCA))时 SNR 增益高达 1.8 倍。与由平均数据创建的金标准数据集参考相比,我们显示 KPCA 比 MPPCA 实现了更低的归一化均方根误差(NRMSE)。残差统计分析显示仅去除了噪声。展示了在扩散模型参数估计(如分数各向异性、平均扩散率与纤维取向分布函数(fODFs))方面的改进。结论:dMRI 信号的非线性冗余可利用 KPCA 挖掘,其允许比最先进 PCA 方法更优的噪声抑制/SNR 提升,且不损失信号信息。

关键词

引用

@article{arxiv.2009.06600,
  title  = {SNR-enhanced diffusion MRI with structure-preserving low-rank denoising in reproducing kernel Hilbert spaces},
  author = {Gabriel Ramos-Llordén and Gonzalo Vegas-Sánchez-Ferrero and Congyu Liao and Carl-Fredrik Westin and Kawin Setsompop and Yogesh Rathi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2009.06600},
  year   = {2020}
}