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使用卷积神经网络在全身梯度回波扫描中分离水与脂肪信号

计算机视觉与模式识别 2019-05-01 v2

摘要

目的:使用卷积神经网络对全身梯度回波扫描进行水-脂肪信号分离并评估其效果。方法:使用了 240 名受试者的全身梯度回波扫描,每次扫描由 5 个双极回波组成。使用常规方法创建参考脂肪分数图。具体使用 2D U-net 卷积神经网络,采用 5 折交叉验证进行训练,以 1 个或多个回波作为输入,并以网络输出与参考脂肪分数图之间的平方差作为损失函数。网络输出通过损失函数、测得的肝脏脂肪分数以及视觉方式进行评估。训练使用图形处理单元(GPU)进行。推理使用 GPU 和中央处理单元(CPU)进行。结果:损失曲线表明已收敛,且使用更多回波作为输入时验证数据的最终损失下降。仅使用 1 个回波即可估计肝脏脂肪分数,但使用更多回波可改善结果。视觉评估发现,即使仅使用 1 个回波,网络输出质量也与参考相似,使用更多回波时有轻微改善。训练网络最多耗时 28.6 小时。使用 GPU 推理一次全身扫描最多耗时 3.7 秒,使用 CPU 则最多耗时 5.8 分钟。结论:可以使用卷积神经网络对全身梯度回波扫描进行水-脂肪信号分离。仅使用 1 个回波即可分离,尽管使用更多回波可改善结果。

关键词

引用

@article{arxiv.1812.04922,
  title  = {Separation of water and fat signal in whole-body gradient echo scans using convolutional neural networks},
  author = {Jonathan Andersson and Håkan Ahlström and Joel Kullberg},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1812.04922},
  year   = {2019}
}

备注

26 pages, 12 figures