基于MRI的植物根系结构重建的鲁棒骨架化方法
计算机视觉与模式识别
2020-10-28 v1
摘要
由于三维测量的低分辨率和低信噪比可能导致根系断裂和错误连接,从MRI中重建植物根系结构具有挑战性。我们提出了一种两阶段方法来解决该任务。第一阶段基于语义上的根与土壤分割,并从任意根体素找到通往地上部的最低代价路径。第二阶段取第一阶段生成的最大全连通分量,并使用三维骨架化提取图结构。我们在22个MRI扫描上评估了我们的方法,并与人类专家重建结果进行了比较。
引用
@article{arxiv.2010.14440,
title = {Robust Skeletonization for Plant Root Structure Reconstruction from MRI},
author = {Jannis Horn and Yi Zhao and Nils Wandel and Magdalena Landl and Andrea Schnepf and Sven Behnke},
journal= {arXiv preprint arXiv:2010.14440},
year = {2020}
}
备注
Accepted final version. In 25th International Conference on Pattern Recognition (ICPR2020)