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医学影像深度学习方法中可复现性的考察

机器学习 2022-10-21 v1 计算机视觉与模式识别 图像与视频处理

摘要

对深度学习研究可复现性的担忧比以往更为突出,且尚无明确解决方案。只有我们同时采用包含可复现性准则的实证严谨性,机器学习研究的相关性才能得以提升,在医学影像领域尤其如此。医学影像与深度学习(MIDL)会议通过倡导开放获取,并近期建议作者公开其代码,在这一方向上取得了进展——这两个方面已被会议大多数投稿所采纳。这有助于方法的可复现性,然而目前对这类补充材料的进一步评估几乎或完全没有支持,使其易受低质量影响,进而波及整个投稿的影响力。我们使用既有的、稍作调整的可复现性及公共仓库质量准则,评估了 2018 至 2022 年间 MIDL 所有被录用的全文投稿。评估显示,发布仓库和使用公共数据集正变得更流行,这有助于可追溯性,但仓库质量多年来并未改善,在仓库设计的各方面均有改进空间。仅 22% 的投稿含有经我们评估被认为可重复的仓库。根据评估中常见的问题,我们提出了一套针对医学影像应用的机器学习相关研究准则,专为未来向 MIDL 的投稿而调整。

关键词

引用

@article{arxiv.2210.11146,
  title  = {Reproducibility of the Methods in Medical Imaging with Deep Learning},
  author = {Attila Simko and Anders Garpebring and Joakim Jonsson and Tufve Nyholm and Tommy Löfstedt},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2210.11146},
  year   = {2022}
}