二价抗衡离子介导的DNA-DNA静电相互作用的再入行为
生物大分子
2011-03-29 v2 亚细胞过程
摘要
利用计算机模拟研究了二价抗衡离子介导的DNA-DNA相互作用问题。尽管二价抗衡离子不能凝聚溶液中的游离DNA分子,但我们表明,如果限制DNA的构型熵,二价抗衡离子可以引起DNA的再入凝聚,类似于三价或四价抗衡离子引起的情况。DNA-DNA相互作用在抗衡离子浓度很小或很大时表现为强排斥,而在中间浓度时可忽略或轻微吸引。讨论了我们的结果对噬菌体DNA喷射实验的启示。该定量结果有助于理解涉及DNA和二价抗衡离子的其他实验中的静电效应。
引用
@article{arxiv.0912.3595,
title = {Reentrant behavior of divalent counterion mediated DNA-DNA electrostatic interaction},
author = {SeIl Lee and Tung T Le and Toan T Nguyen},
journal= {arXiv preprint arXiv:0912.3595},
year = {2011}
}
备注
4 pages, 3 figures, accepted for publication in Phys. Rev. Lett. (2010)