免疫生物学中的稀有事件模拟：T 细胞成熟中的阴性选择模型
细胞行为
2014-07-22 v1 概率论
分子网络
摘要
我们提出了一种包含阴性选择的概率 T 细胞模型，并考虑了胸腺中组织限制性抗原 (TRA) 表达的对比模型。我们从 van den Berg、Rand 和 Burroughs (2001) 的基础模型出发，通过基于个体的 T 细胞建模纳入阴性选择，其中每个 T 细胞由其对所有相关自身抗原的刺激率定义。我们提出了一种基于对单个 T 细胞识别的刺激率进行部分倾斜 (partial tilting) 的模拟方法。我们研究了阴性选择对不同胸腺抗原呈递模式的影响，即任意 TRA 呈递与对组织特异性细胞系或多或少严格的模拟。我们观察到，阴性选择导致成熟 T 细胞从自身抗原接收的刺激率分布尾部被截断，即自身背景降低。这增加了存在非自身抗原时单个 T 细胞的激活概率。
引用
@article{arxiv.1407.5503,
title = {Rare event simulation in immune biology: Models of negative selection in T-cell maturation},
author = {Corinna Ernst and Ellen Baake},
journal= {arXiv preprint arXiv:1407.5503},
year = {2014}
}
备注
13 pages, 5 figures; accepted for 10th International Workshop on Rare Event Simulation, Amsterdam, Aug. 27-29, 2014