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利用度量学习对基因工程DNA的 origin 实验室进行排序

机器学习 2021-07-19 v1 人工智能 神经与进化计算

摘要

随着基因工程的不断进步,一个普遍的关切是能够识别基因工程DNA序列的origin实验室。为此,AltLabs举办了基因工程归因挑战赛,召集许多团队提出新工具以解决此问题。这里我们展示我们提出的方法,用于对最可能的origin实验室进行排序并为DNA序列和实验室生成嵌入表示。这些嵌入还能执行各种其他任务,如聚类DNA序列和实验室,并将其用作机器学习模型的特征以解决其他问题。本工作表明,我们的方法在生成其他有用信息的同时,优于该任务的经典训练方法。

关键词

引用

@article{arxiv.2107.07878,
  title  = {Ranking labs-of-origin for genetically engineered DNA using Metric Learning},
  author = {I. Muniz and F. H. F. Camargo and A. Marques},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2107.07878},
  year   = {2021}
}

备注

4 pages, 2 figures, 1 algorithm