蛋白质-配体相互作用的量子计算量化
量子物理
2022-08-24 v1 生物物理
摘要
我们展示了一种用于量化蛋白质-配体相互作用的原型混合经典-量子计算工作流。该工作流将密度矩阵嵌入理论（DMET）嵌入程序与变分量子本征求解器（VQE）方法相结合，以寻找分子电子基态。使用在最新超导 transmon（IBM）和离子阱（Honeywell）含噪中等规模量子（NISQ）设备上计算的结合能差异，对一系列 -分泌酶（BACE1）抑制剂进行排名。这是真实量子计算机首次应用于蛋白质-配体结合能的计算。结果揭示了将使 NISQ 算法应用于药物设计成为可能的硬件和软件需求。
引用
@article{arxiv.2110.08163,
title = {Quantum Computational Quantification of Protein-Ligand Interactions},
author = {Josh John Mellor Kirsopp and Cono Di Paola and David Zsolt Manrique and Michal Krompiec and Gabriel Greene-Diniz and Wolfgang Guba and Agnes Meyder and Detlef Wolf and Martin Strahm and David Muñoz Ramo},
journal= {arXiv preprint arXiv:2110.08163},
year = {2022}
}
备注
12 pages, 12 figures