PyPanda：用于基因调控网络重构的Python包
定量方法
2016-07-14 v2
摘要
PANDA（Passing Attributes between Networks for Data Assimilation）是一种利用消息传递整合多源组学数据（'omics data）的基因调控网络推断方法。PANDA最初用C++编写。在本应用说明中，我们描述PyPanda，即PANDA的Python版本。PyPanda运行比C++版本明显更快，并包含用于网络分析的附加功能。可用性：开源PyPanda Python包可在 https://github.com/davidvi/pypanda 免费获取。联系：d.g.p.van [email protected]
引用
@article{arxiv.1604.06783,
title = {PyPanda: a Python Package for Gene Regulatory Network Reconstruction},
author = {David G. P. van IJzendoorn and Kimberly Glass and John Quackenbush and Marieke L. Kuijjer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1604.06783},
year = {2016}
}
备注
3 pages, 1 figure; version after Bioinformatics proofs