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Pin-Tuning:用于少样本分子性质预测的参数高效上下文内微调

机器学习 2024-11-05 v1 人工智能 分子网络

摘要

分子性质预测(MPP)是药物发现和材料科学的核心,但在现实场景中常面临数据稀缺的挑战。为此,少样本分子性质预测(FSMPP)应运而生。与其他少样本任务不同,FSMPP通常采用预训练分子编码器和上下文感知分类器,受益于分子预训练和分子上下文信息。尽管取得了这些进展,现有方法在预训练编码器的微调方面仍存在困难。我们将此问题归因于可微调参数丰富与标注分子稀缺之间的不平衡,以及编码器中缺乏上下文感知能力。为克服这一障碍,我们提出了一种参数高效的上下文内微调方法——Pin-Tuning。具体而言,我们为预训练消息传递层提出轻量级适配器(MP-Adapter),为预训练原子/键嵌入层提出贝叶斯权重整合(Emb-BWC),以实现参数高效的微调,同时防止过拟合和灾难性遗忘。此外,我们通过上下文感知能力增强了MP-Adapter。这一创新使得预训练编码器的上下文内微调成为可能,从而提升了其对特定FSMPP任务的适应性。在公开数据集上的评估表明,我们的方法以更少的可训练参数实现了更优的微调效果,提升了少样本预测性能。

关键词

引用

@article{arxiv.2411.01158,
  title  = {Pin-Tuning: Parameter-Efficient In-Context Tuning for Few-Shot Molecular Property Prediction},
  author = {Liang Wang and Qiang Liu and Shaozhen Liu and Xin Sun and Shu Wu and Liang Wang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2411.01158},
  year   = {2024}
}

备注

Accepted by NeurIPS 2024