基于块的编码器-解码器架构用于自动透射光到荧光成像转换：对LightMyCells挑战赛的贡献
图像与视频处理
2024-06-04 v1 计算机视觉与模式识别
机器学习
摘要
从无标记透射光输入图像自动预测荧光标记的细胞器是一项重要但困难的任务。获得荧光图像的传统方式与进行生化标记有关，这既耗时又昂贵。因此，基于无标记透射光显微镜的自动算法可能非常有益。该任务的重要性促使法国生物成像组织者组织了LightMyCells挑战赛，其目标是提出一种算法，基于由明场、相差或微分干涉相差显微镜图像组成的输入，自动预测荧光标记的细胞核、线粒体、微管蛋白和肌动蛋白。在这项工作中，我们介绍了AGHSSO团队的贡献，该贡献基于精心准备和训练的编码器-解码器深度神经网络，在挑战赛中取得了可观的分数，跻身表现最佳的团队之列。
引用
@article{arxiv.2406.01187,
title = {Patch-Based Encoder-Decoder Architecture for Automatic Transmitted Light to Fluorescence Imaging Transition: Contribution to the LightMyCells Challenge},
author = {Marek Wodzinski and Henning Müller},
journal= {arXiv preprint arXiv:2406.01187},
year = {2024}
}