部分域适应器实现 scRNA-seq 与 snRNA-seq 之间的跨域细胞类型注释
基因组学
2026-03-10 v3
摘要
跨数据集准确细胞类型注释是单细胞分析中的关键挑战。snRNA-seq 使对冻存组织或难以破裂的组织进行轮廓化，补充了 scRNA-seq，通过捕获脆弱或稀有细胞类型。然而，跨注释在这两类数据集之间仍基本未被探索，因为现有方法将它们独立处理。我们引入 ScNucAdapt，一种针对成对和非成对 scRNA-seq 与 snRNA-seq 数据集进行跨注释的方法。为解决分布差异和细胞组成差异，ScNucAdapt 采用部分域适应。实验在成对和非成对 scRNA-seq 与 snRNA-seq 数据集上表明，ScNucAdapt 实现了稳健且准确的细胞类型注释，超越了现有方法。因此，ScNucAdapt 提供了一个在 scRNA-seq 和 snRNA-seq 数据之间进行跨域细胞类型注释的实用框架。
关键词
引用
@article{arxiv.2511.08996,
title = {Partial domain adaptation enables cross domain cell type annotation between scRNA-seq and snRNA-seq},
author = {Xiran Chen and Quan Zou and Qinyu Cai and Xiaofeng Chen and Weikai Li and Yansu Wang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2511.08996},
year = {2026}
}