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用于估计大型精度矩阵的偏相关筛选法及其在分类中的应用

统计方法学 2014-09-12 v1 统计理论 统计理论

摘要

我们提出偏相关筛选 (PCS) 作为一种新的逐行方法来估计大型精度矩阵 Ω\Omega。为了估计 Ω\Omega 的第 ii 行 (1ip1 \leq i \leq p),PCS 使用一个筛选步骤和一个清洗步骤。在筛选步骤中,PCS 利用分阶段算法招募一个(小型)索引子集,其中在每个阶段,算法通过添加与 ii 具有最大(绝对值)经验偏相关的索引 jj 来更新已招募的索引集。在清洗步骤中,PCS 重新调查所有已招募的索引,并利用它们重构 Ω\Omega 的第 ii 行。PCS 计算效率高且内存占用适中:为了估计 Ω\Omega 的一行,它只需要经验协方差矩阵的少数几行(按顺序确定)。这使得 PCS 能够在几分钟内执行大型精度矩阵(例如 p=10Kp=10K)的估计,并为估计更大的精度矩阵打开了大门。我们将 PCS 用于分类。高阶批评阈值化 (HCT) 是一种近期享有最优性的分类器,但在实践中要充分发挥其潜力,需要对精度矩阵 Ω\Omega 进行良好的估计。将 HCT 与任何估计 Ω\Omega 的方法结合可产生一种新的分类器:示例包括 HCT-PCS 和 HCT-glasso。我们将 HCT-PCS 应用于两个大型微阵列数据集(p=8Kp = 8K10K10K)进行分类,结果显示其不仅显著优于 HCT-glasso,而且与支持向量机 (SVM) 和随机森林 (RF) 具有竞争力。结果表明,PCS 给出的 Ω\Omega 估计比 glasso 更有用。我们建立了一个通用的理论框架,并表明在广泛背景下,PCS 能完全恢复 Ω\Omega 的支撑集,且 HCT-PCS 产生最优的分类行为。我们的证明揭示了分阶段过程行为的有趣特性。

关键词

引用

@article{arxiv.1409.3301,
  title  = {Partial Correlation Screening for Estimating Large Precision Matrices, with Applications to Classification},
  author = {Shiqiong Huang and Jiashun Jin and Zhigang Yao},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1409.3301},
  year   = {2014}
}

备注

47 pages, 10 figures