蛙类壶菌病基于个体模型参数推断
定量方法
2010-11-10 v2 种群与进化
摘要
基于个体的模型（IBM）和基于主体的模型（ABM）已成为理解复杂生物系统的广泛使用的工具。然而，目前尚无针对IBM的通用参数推断方法。本文以一个为描述蛙类种群中壶菌病传播而开发的IBM为例，表明使用传统的基于似然的方法可以解决此问题。我们证明，如果IBM满足特定标准，我们可以解析地求出似然（或后验），并使用标准计算技术（如马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC））进行参数推断。
引用
@article{arxiv.1008.0746,
title = {Parameter Inference for an Individual Based Model of Chytridiomycosis in Frogs},
author = {Leah R. Johnson and Cheryl J. Briggs},
journal= {arXiv preprint arXiv:1008.0746},
year = {2010}
}
备注
1 Table, 5 Figures